آلودگی ناشی از ورود بی‌رویه فاضلاب شهری و خانگی، در کنار آلاینده‌های نفتی حاصل از تردد نفت‌کش‌ها و فرسودگی خطوط لوله انتقال نفت، اکوسیستم دریایی جنوب کشور را سال‌هاست به بحرانی جدی دچار کرده است. این معضل، تهدیدی جدی برای تنوع زیستی خلیج فارس و دریای خزر به شمار می‌رود.